親緣樹 - 拼圖

Isla avatar
By Isla
at 2009-06-02T21:17

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本人的生物只有高中假三類的水準,

因此以下的言論可能不盡然正確,

只是本人的猜想。

========================我是分隔線===========================


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A C B D F E

基本上,由上面的圖我們可以得到一個資訊:

最初始的時候只有一個物種(假設叫做O物種)

而且,根據演化論,演化無時無刻都在進行,

因此,上圖的綠色路線並不代表E物種沒有演化,

而是在演化的過程中並沒有跑出另一個物種出來,

沒有必要另外改名稱。

那甚麼時候會出現新的物種呢?

根據生物的分類方式,對於物種的定義有許多方法,

最基本的是外觀,比如雞與牛沒有人會想成是同一物種

如果是有性生殖的話,同物種必須要有辦法在自然的情況下交配,

而且後代必須要有繁殖能力 (因此馬和驢屬於不同物種,即便他們可以生出騾子)

而對於無性生殖,根據維基百科,他們的rRNA序列必須要有97%以上的相似度。

(對有性生殖的生物來說,97%以下的相似度也足以讓他們無法生出下一代

Ex: 人和猩猩的基因有99.4%相似)




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A C B D F E

於是,我們比較A、C、E三個物種

當A和C還是同一個物種時,他們和E的基因組的相似度就已經低於97%了

因此,雖然A、C後來分家了,但是他們的親源關係還是比較接近。

舉例而言,人和猩猩可以分別當A和C,鯨魚就當E吧

雖然ACE都是哺乳類,在演化上都屬於 哺乳綱 ,

但是某一天[人和猩猩]的祖先和鯨魚的祖先分家了

之後過了幾年,人和猩猩才分家,很明顯的,人和猩猩的親源比鯨魚來的近。



或著是說,越早的分支代表著越基層的差異,

比如說動物和植物有著根本上的不同,

任意兩種動物之間的親源一定比動物和植物間的親源來的近。

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All Comments

Callum avatar
By Callum
at 2009-06-04T20:11
那看樣子「輩份」說是OK的了...雖然這樣很不專業^^"
Damian avatar
By Damian
at 2009-06-07T03:05
也就是說我之前的想法是漏掉時間的因素...嗯,有FU了 謝謝
Jacob avatar
By Jacob
at 2009-06-11T09:30
感謝 stimim 的解釋
Puput avatar
By Puput
at 2009-06-13T16:45
關於親緣樹,請參考霍夫曼樹編碼規則,每個樹葉皆有一專門碼
Agnes avatar
By Agnes
at 2009-06-14T03:04
關於碼之間的像似性請參考生物資訊中的LCS演算法則
George avatar
By George
at 2009-06-19T00:02
生物資訊中比對多條序列並不是用霍夫曼數來實踐的
Eartha avatar
By Eartha
at 2009-06-23T10:44
不過它卻是廣泛的示意兩者間的親近關係
Ursula avatar
By Ursula
at 2009-06-24T17:48
比對的名稱叫多重序列特徵性查找
Olive avatar
By Olive
at 2009-06-27T17:22
霍夫曼樹則用於二元數值數據通訊,很多壓縮都可以見到這個

親緣樹

Kelly avatar
By Kelly
at 2009-06-02T15:36
因為我不懂所謂的親緣樹 所以想有空自己去弄懂再回過頭來看 如果以下有什麼詞彙是運用錯誤的 還請多多見諒 只是想提出個人的疑惑點而已 為什麼我會感到疑惑呢? 因為我一直深植著一個觀念 那就是「親緣愈近=dna愈相似」 我們都知道 下一代的dna 都會有些許不同 (指有性生殖,無性生殖不知道) 所以親緣 ...

請問市面上還有類似發現小花的書可以買嗎?

Isla avatar
By Isla
at 2009-06-02T15:06
原本想要買姊妹作發現小船的,結果各大網路購書都沒有庫存, 實體的重慶南路一帶也沒有,只好先放下怨念。 但是還有類似發現小花這種的書嗎? 因為現在台灣的出版業光看書名實在很難想像內容是什麼。 所以來板上詢問一下。謝謝。 -- ht ...

親緣樹

Steve avatar
By Steve
at 2009-06-02T02:28
※ 引述《arist ( 在他方 )》之銘言: : [簡介] : 在生物資訊中,其中一個關心的問題就是如何還原重建出物種的演化樹(如下圖)。 : 從此演化樹中,任取三個我們可以看出哪兩個有比較近的親緣關係。 : 例如: : 取 A,B,C 來看,知 A,C 的親緣較近,B 和另兩個較遠,將之記 ...

ㄧ個問題...關於兩個水桶的

Ina avatar
By Ina
at 2009-06-01T16:23
小弟前幾天又看到and#34;很難死and#34;中..那個3公升和5公升水桶取4公升水的劇情了... 這時候我突然想到...那可以取0.5公升的水嗎?? 想了ㄧ下應該是不可能的...因此我想了ㄧ個題目...想請大家想想.. 現在有3公升和5公升的水桶各一個...以及一個天平... 但是5公升的水 ...

親緣樹

Andy avatar
By Andy
at 2009-05-31T11:21
[簡介] 在生物資訊中,其中一個關心的問題就是如何還原重建出物種的演化樹(如下圖)。 從此演化樹中,任取三個我們可以看出哪兩個有比較近的親緣關係。 例如: 取 A,B,C 來看,知 A,C 的親緣較近,B 和另兩個較遠,將之記作 [(A,C),B]。 取 C,D,E 來看,知 C,D 的親緣較近,E 和 ...