親緣樹 - 拼圖

Table of Contents


本人的生物只有高中假三類的水準,

因此以下的言論可能不盡然正確,

只是本人的猜想。

========================我是分隔線===========================


╱╲
╱ ╲
╱ ╱╲
╱╲ ╱ ╱╲
A C B D F E

基本上,由上面的圖我們可以得到一個資訊:

最初始的時候只有一個物種(假設叫做O物種)

而且,根據演化論,演化無時無刻都在進行,

因此,上圖的綠色路線並不代表E物種沒有演化,

而是在演化的過程中並沒有跑出另一個物種出來,

沒有必要另外改名稱。

那甚麼時候會出現新的物種呢?

根據生物的分類方式,對於物種的定義有許多方法,

最基本的是外觀,比如雞與牛沒有人會想成是同一物種

如果是有性生殖的話,同物種必須要有辦法在自然的情況下交配,

而且後代必須要有繁殖能力 (因此馬和驢屬於不同物種,即便他們可以生出騾子)

而對於無性生殖,根據維基百科,他們的rRNA序列必須要有97%以上的相似度。

(對有性生殖的生物來說,97%以下的相似度也足以讓他們無法生出下一代

Ex: 人和猩猩的基因有99.4%相似)




╱╲
╱ ╱╲
A C B D F E

於是,我們比較A、C、E三個物種

當A和C還是同一個物種時,他們和E的基因組的相似度就已經低於97%了

因此,雖然A、C後來分家了,但是他們的親源關係還是比較接近。

舉例而言,人和猩猩可以分別當A和C,鯨魚就當E吧

雖然ACE都是哺乳類,在演化上都屬於 哺乳綱 ,

但是某一天[人和猩猩]的祖先和鯨魚的祖先分家了

之後過了幾年,人和猩猩才分家,很明顯的,人和猩猩的親源比鯨魚來的近。



或著是說,越早的分支代表著越基層的差異,

比如說動物和植物有著根本上的不同,

任意兩種動物之間的親源一定比動物和植物間的親源來的近。

--

All Comments

Callum avatarCallum2009-06-04
那看樣子「輩份」說是OK的了...雖然這樣很不專業^^"
Damian avatarDamian2009-06-07
也就是說我之前的想法是漏掉時間的因素...嗯,有FU了 謝謝
Jacob avatarJacob2009-06-11
感謝 stimim 的解釋
Puput avatarPuput2009-06-13
關於親緣樹,請參考霍夫曼樹編碼規則,每個樹葉皆有一專門碼
Agnes avatarAgnes2009-06-14
關於碼之間的像似性請參考生物資訊中的LCS演算法則
George avatarGeorge2009-06-19
生物資訊中比對多條序列並不是用霍夫曼數來實踐的
Eartha avatarEartha2009-06-23
不過它卻是廣泛的示意兩者間的親近關係
Ursula avatarUrsula2009-06-24
比對的名稱叫多重序列特徵性查找
Olive avatarOlive2009-06-27
霍夫曼樹則用於二元數值數據通訊,很多壓縮都可以見到這個