[簡介]
在生物資訊中,其中一個關心的問題就是如何還原重建出物種的演化樹(如下圖)。
從此演化樹中,任取三個我們可以看出哪兩個有比較近的親緣關係。
例如:
取 A,B,C 來看,知 A,C 的親緣較近,B 和另兩個較遠,將之記作 [(A,C),B]。
取 C,D,E 來看,知 C,D 的親緣較近,E 和另兩個較遠,將之記作 [(C,D),E]。
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A C B D F E
當然,有了演化樹,我們要得出親緣關係,是很容易。
但反之,若我們只有親緣關係,要如何重建演化樹呢?
(在實際問題中,因實驗會有誤差,有時有一小部分的關係是錯誤的,
如何在允許部分錯誤下去還原整個樹更是複雜的問題)
[遊戲規則] (基本版)
1. 兩人先各自劃一個演化樹(可依難易度調整遊戲的物種數目),
2. 每回合兩人輪流詢問對方一個[三物種的親緣關係],
3. 被詢問者要回答哪兩個物種關係較近。
4. 重複 2.3 的情況,直到有一方宣稱他已經重建整個演化樹。
若公布結果時,其答案為正確,則為勝,否者為輸。
[遊戲規則] (進階版)
在 3. 中,允許至多一次說謊的機會。
[暖身練習]
已知 6 物種的親緣關係如下:
[(A,B),C], [(C,D),B)] , [(C,D),E], [(D,E),F], [(A,E),F]
你有辦法重建,唯一的演化樹嗎?
若還不為一,你會想要再詢問哪三個物種關係呢?
[益智問題]
若在6個物種下,有辦法確定幾次內衣定可以得出答案呢?
(有Error, 和沒 Error 的情況各為何?)
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