親緣樹 - 拼圖

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[簡介]

在生物資訊中,其中一個關心的問題就是如何還原重建出物種的演化樹(如下圖)。
從此演化樹中,任取三個我們可以看出哪兩個有比較近的親緣關係。

例如:
取 A,B,C 來看,知 A,C 的親緣較近,B 和另兩個較遠,將之記作 [(A,C),B]。
取 C,D,E 來看,知 C,D 的親緣較近,E 和另兩個較遠,將之記作 [(C,D),E]。


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A C B D F E

當然,有了演化樹,我們要得出親緣關係,是很容易。
但反之,若我們只有親緣關係,要如何重建演化樹呢?
(在實際問題中,因實驗會有誤差,有時有一小部分的關係是錯誤的,
如何在允許部分錯誤下去還原整個樹更是複雜的問題)


[遊戲規則] (基本版)

1. 兩人先各自劃一個演化樹(可依難易度調整遊戲的物種數目),
2. 每回合兩人輪流詢問對方一個[三物種的親緣關係],
3. 被詢問者要回答哪兩個物種關係較近。
4. 重複 2.3 的情況,直到有一方宣稱他已經重建整個演化樹。
若公布結果時,其答案為正確,則為勝,否者為輸。


[遊戲規則] (進階版)

在 3. 中,允許至多一次說謊的機會。


[暖身練習]

已知 6 物種的親緣關係如下:
[(A,B),C], [(C,D),B)] , [(C,D),E], [(D,E),F], [(A,E),F]

你有辦法重建,唯一的演化樹嗎?
若還不為一,你會想要再詢問哪三個物種關係呢?


[益智問題]

若在6個物種下,有辦法確定幾次內衣定可以得出答案呢?
(有Error, 和沒 Error 的情況各為何?)



















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All Comments

Emma avatarEmma2009-06-05
想找人試玩的可以丟我水球
Jacky avatarJacky2009-06-06
請問原PO的舉例中
BDF誰比較近?一樣嗎?
Enid avatarEnid2009-06-07
咦等等- -a
Dorothy avatarDorothy2009-06-08
沒事我瞭了XD(請無視我XD)
Olive avatarOlive2009-06-10
呃好像還是有疑問XD
Yedda avatarYedda2009-06-15
呃我又沒問題了.................呃我糊塗了XD
Gilbert avatarGilbert2009-06-18
(無限鬼打牆ing....XD)
Vanessa avatarVanessa2009-06-19
暖身我無法推出.......問ABE親源?
Bennie avatarBennie2009-06-21
暖身題跟樓上一樣之問ABE親緣?
Tristan Cohan avatarTristan Cohan2009-06-25
第一個例子的C,D,E我沒有弄懂...他們都是五等親不是嗎?
Donna avatarDonna2009-06-29
好像應該是[(C,E),D]才對......
Audriana avatarAudriana2009-07-01
延伸交點
Edwina avatarEdwina2009-07-06
CD 的親緣比較近, CE 的親緣比較遠 是 [(C,D),E] 沒錯
Zora avatarZora2009-07-11
E 在一開始就和 {A,B,C,D,F} 分化了,所以E 距大家都很遠
Aaliyah avatarAaliyah2009-07-14
接著 {A,B,C,D,F} 又分化為 {A,C} {B,D,F} 兩堆
Rebecca avatarRebecca2009-07-15
暖身題加 [(A,E),B]則解為 ((((A,E),B),(C,D)),F)
Kyle avatarKyle2009-07-19
若再加 [(A,B),E] 則解還不唯一
Edith avatarEdith2009-07-21
暖身再問BCE
Edwina avatarEdwina2009-07-23
呃我是指如果是[(A,B),E]
Lily avatarLily2009-07-28
想很久還是無法理解@@" 我先留給其他人做,自己以後再說吧
Irma avatarIrma2009-07-28
好像只差[A或B 與 C或D 與 E]了........
Doris avatarDoris2009-08-02
那暖身題只是熟悉一下規則
Tristan Cohan avatarTristan Cohan2009-08-03
實際雙人玩時,要怎樣來問親緣關係是個比較有趣的問題