親緣樹 - 拼圖

Andy avatar
By Andy
at 2009-05-31T11:21

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[簡介]

在生物資訊中,其中一個關心的問題就是如何還原重建出物種的演化樹(如下圖)。
從此演化樹中,任取三個我們可以看出哪兩個有比較近的親緣關係。

例如:
取 A,B,C 來看,知 A,C 的親緣較近,B 和另兩個較遠,將之記作 [(A,C),B]。
取 C,D,E 來看,知 C,D 的親緣較近,E 和另兩個較遠,將之記作 [(C,D),E]。


╱╲
╱╲ ╲
╱ ╲ ╲
╱ ╱╲ ╲
╱╲ ╱ ╱╲ ╲
A C B D F E

當然,有了演化樹,我們要得出親緣關係,是很容易。
但反之,若我們只有親緣關係,要如何重建演化樹呢?
(在實際問題中,因實驗會有誤差,有時有一小部分的關係是錯誤的,
如何在允許部分錯誤下去還原整個樹更是複雜的問題)


[遊戲規則] (基本版)

1. 兩人先各自劃一個演化樹(可依難易度調整遊戲的物種數目),
2. 每回合兩人輪流詢問對方一個[三物種的親緣關係],
3. 被詢問者要回答哪兩個物種關係較近。
4. 重複 2.3 的情況,直到有一方宣稱他已經重建整個演化樹。
若公布結果時,其答案為正確,則為勝,否者為輸。


[遊戲規則] (進階版)

在 3. 中,允許至多一次說謊的機會。


[暖身練習]

已知 6 物種的親緣關係如下:
[(A,B),C], [(C,D),B)] , [(C,D),E], [(D,E),F], [(A,E),F]

你有辦法重建,唯一的演化樹嗎?
若還不為一,你會想要再詢問哪三個物種關係呢?


[益智問題]

若在6個物種下,有辦法確定幾次內衣定可以得出答案呢?
(有Error, 和沒 Error 的情況各為何?)



















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Tags: 拼圖

All Comments

Emma avatar
By Emma
at 2009-06-05T05:36
想找人試玩的可以丟我水球
Jacky avatar
By Jacky
at 2009-06-06T08:12
請問原PO的舉例中
BDF誰比較近?一樣嗎?
Enid avatar
By Enid
at 2009-06-07T17:34
咦等等- -a
Dorothy avatar
By Dorothy
at 2009-06-08T05:58
沒事我瞭了XD(請無視我XD)
Olive avatar
By Olive
at 2009-06-10T14:48
呃好像還是有疑問XD
Yedda avatar
By Yedda
at 2009-06-15T05:50
呃我又沒問題了.................呃我糊塗了XD
Gilbert avatar
By Gilbert
at 2009-06-18T04:04
(無限鬼打牆ing....XD)
Vanessa avatar
By Vanessa
at 2009-06-19T06:19
暖身我無法推出.......問ABE親源?
Bennie avatar
By Bennie
at 2009-06-21T23:43
暖身題跟樓上一樣之問ABE親緣?
Tristan Cohan avatar
By Tristan Cohan
at 2009-06-25T03:10
第一個例子的C,D,E我沒有弄懂...他們都是五等親不是嗎?
Donna avatar
By Donna
at 2009-06-29T05:40
好像應該是[(C,E),D]才對......
Audriana avatar
By Audriana
at 2009-07-01T10:53
延伸交點
Edwina avatar
By Edwina
at 2009-07-06T07:27
CD 的親緣比較近, CE 的親緣比較遠 是 [(C,D),E] 沒錯
Zora avatar
By Zora
at 2009-07-11T00:05
E 在一開始就和 {A,B,C,D,F} 分化了,所以E 距大家都很遠
Aaliyah avatar
By Aaliyah
at 2009-07-14T03:11
接著 {A,B,C,D,F} 又分化為 {A,C} {B,D,F} 兩堆
Rebecca avatar
By Rebecca
at 2009-07-15T11:38
暖身題加 [(A,E),B]則解為 ((((A,E),B),(C,D)),F)
Kyle avatar
By Kyle
at 2009-07-19T07:31
若再加 [(A,B),E] 則解還不唯一
Edith avatar
By Edith
at 2009-07-21T08:37
暖身再問BCE
Edwina avatar
By Edwina
at 2009-07-23T07:29
呃我是指如果是[(A,B),E]
Lily avatar
By Lily
at 2009-07-28T06:12
想很久還是無法理解@@" 我先留給其他人做,自己以後再說吧
Irma avatar
By Irma
at 2009-07-28T19:39
好像只差[A或B 與 C或D 與 E]了........
Doris avatar
By Doris
at 2009-08-02T11:32
那暖身題只是熟悉一下規則
Tristan Cohan avatar
By Tristan Cohan
at 2009-08-03T21:20
實際雙人玩時,要怎樣來問親緣關係是個比較有趣的問題

想找3D立體球型拼圖

Faithe avatar
By Faithe
at 2009-05-30T00:55
想找 3D球型拼圖 排球圖案的 網路上找過很多,雷諾瓦也去問過了 但是都找不到 都只有找到 籃球 足球 不知道有誰知道哪裡可以尋到 感謝 - ...

拼圖皺皺的

Lily avatar
By Lily
at 2009-05-28T19:21
放了兩年左右的拼圖, 是表一般最便宜的鐵框 (有上膠) 最近覺得他變的皺皺的 問雷諾瓦的店員, 他表示是吸收了水氣變成這樣的 請問版友有遇到這樣的情況嗎? 該怎麼處理? (我已經開始想用熨斗去燙燙看了XD ) - ...

公館謎屋

Connor avatar
By Connor
at 2009-05-27T13:46
就我所知該店有會員制 請問一下板上的朋友 有哪位有可以打77折的會員卡呢orz 最近想買來拼啊~ - ...

雷諾瓦拼圖賽

Annie avatar
By Annie
at 2009-05-27T12:51
詳情請洽: http://newweb.renoirpuzzle.com.tw/deflf7.php?menuID=427 【挑戰賽】 個人賽 時間: 6/27~7/31 地點: 各分店 報名時間: 5/28起 報名費: $600 $550 (6/2 ...

一個益智遊戲的網頁

Adele avatar
By Adele
at 2009-05-26T23:04
http://homepage3.nifty.com/puzzlehouse/ 日本的網頁,上面有頗多益智小遊戲,可以玩玩看! 包含有拼圖、各式數學遊戲、火柴謎題等等 另要注意的是網頁上的遊戲都是JAVA製作,所以要裝JAVA才能玩 JAVA:http://www.java.com/zh_TW/dow ...